规划指出，“十三五”时期是全面建成小康社会的决胜阶段，也是科协事业改革发展的重要机遇期。学会学术工作要坚持改革驱动、强基固本、助力创新、协同开放的基本原则，实现以下任务目标：学会治理结构和治理方式改革取得初步成效，学术建设能力、社会服务能力和基础保障能力明显提高，科协所属学会占全国科技类社团的比例总体稳定，优质学会占比大幅度上升，会员占全国科技工作者比例明显提高。科技工作者“短板攻坚竞突破，科技前沿竞带跑，创业转化竞实效，普及服务竞贡献”实效明显。学会发展活力、凝聚力、服务能力、影响力大幅提升。学术交流更加活跃，学术环境明显优化，原始创新能力不断增强，涌现出一批具有世界先进水平的优质科技成果和杰出科学家，中国科学家的国际话语权和影响力明显提高。学会助力创新发展、承接政府转移职能的领域进一步拓宽，科技成果转化率明显提高，在公共服务产品市场上占有重要地位，形成适应创新发展需要的工作格局，使学会提供科技类社会化公共服务产品的市场占有率大幅度提高，真正成为国家创新体系建设的重要力量。
规划明确了“十三五”时期学会学术工作创新发展的主要数据指标：打造20个优先建设学会，50个重点建设学会，30个特色建设学会；培育10-15个品牌学术会议、100个示范学术会议；打造50种攀登世界科技高峰的英文期刊，20种进入世界期刊学科排名Q1区；参与助力工程的学会达到100个，创新驱动示范市达到40个，学会牵头成立25个产业协同创新共同体，建立200个示范院士专家工作站；通过青年人才托举工程遴选支持1000名青年优质科技工作者。
规划提出了“十三五”时期学会学术工作的四大工作领域，全面推进学会治理体系改革、努力在科技创新主战场上奋发有为、积极进军经济建设主战场、稳妥推进学会有序承接政府转移职能。为如期实现各项目标任务，规划提出了加强组织协同，强化队伍建设，确保资源配置，建立监测评估和动态调整机制的四项保障措施。
规划要求，“十三五”时期，学会学术工作要按照“四个全面”的战略布局和“五位一体”的总体布局，坚持创新、协调、绿色、开放、共享的发展理念，坚持把学会工作作为科协主体工作，以扩大学会组织覆盖和工作覆盖、提升学会创新和发展能力为导向，以深化学会治理结构和治理方式改革为主线，以积极进军科技创新和经济建设主战场为重点，构建学会学术工作新格局，突出代表科技界的重要功能，广泛开展“创新争先行动”，把科技工作者紧紧团结凝聚起来，为夺取全面建成小康社会决胜阶段新胜利作出新的更大贡献
